La chiesa di San Pio da Pietrelcina si trova a San Giovanni Rotondo, ed è dedicata a Padre Pio.
Il santuario di San Pio da Pietrelcina è stato progettato dal famoso architetto Renzo Piano, e realizzato tra il 1994 e il 2004.
La chiesa di San Giovanni Rotondo si trova sul monte ed è vicina al santuario e convento in cui il frate visse, e dove le sue spoglie furono conservate prima del trasferimento nella nuova chiesa dedicata a lui. La sua forma è ispirata al nautilus, con la pianta che richiama la spirale archimedea, e l'altare è collocato al centro dell'aula liturgica.
Accanto alla chiesa, è stato costruito un grande sagrato collegato tramite un'enorme vetrata e un viale di accesso. La novità architettonica di questo progetto è l'utilizzo della pietra di Apricena come struttura resistente, oltre che decorativa. Questa scelta ha comportato test e sperimentazioni per assicurarne la resistenza sismica in un'area ad alto rischio sismico. Grazie a notevoli sperimentazioni tecnologiche, la struttura può ora sopportare forze fino a 6 volte superiori a quelle dei terremoti registrati nella zona, nonostante la poca duttilità del materiale.